ככלי עיבוד מורכב, המחרטה דורשת תפעול מקצועי ונכון של המפעיל.
נוהל ההפעלה הכללי של מחרטה הוא כדלקמן:
בדיקת מצב ולבוש: לפני שמתחילים את המחרטה, בדוק את מצב כל הרכיבים, כולל קווי שמן, חלקים מסתובבים, ידיות, חגורות הנעה, כיסויי בטיחות ציוד וכו', כדי לוודא שהם תקינים. על המפעילים ללבוש לבוש מתאים, כולל חפתים הדוקים ומשקפי ראייה; אסור להשתמש בכפפות.
התקנת חומר עבודה: יש להדק את חומר העבודה בצורה מאובטחת ונכונה. עבור חלקי עבודה גדולים, יש להניח לוח עץ על המחרטה. עבור חלקי עבודה ארוכים מדי, יש להשתמש בתושבת תמיכה.
התקנת הכלי: על כלי החיתוך להיות מהודק היטב. עומק החיתוך לא יעלה על העומס, ואסור לקצה הכלי לבלוט יתר על המידה. מחזיק הכלים חייב להיות נעול במהלך חיתוך וטעינת/פריקת הכלים. זכור לבדוק את מיקומי הגבול לאחר התקנת הכלי.
פעולת עיבוד שבבי: במהלך העיבוד, אין לשנות את מהירות הציר, אין למדוד את מידות היצירה, ואין לגעת בחומר ובשבבים ביד. שמור על ריכוז מוחלט. בעת ליטוש חומר העבודה עם מטלית, העבר את כלי החיתוך למצב בטוח. אל תניח כלים או חלקים על משטח מחזיק הכלי. בעת הפעלת מחרטה, התקרב לאט אל חומר העבודה עם כלי החיתוך כדי למנוע שברי מתכת יתעופפו החוצה ויגרמו לפציעה. תמיד נתק את החשמל לפני עזיבת המחרטה.
עיבוד שלאחר-: לאחר השלמת העיבוד, אחסן כראוי את חומר העבודה וכלי החיתוך. נקה את המחרטה וכבה את החשמל.
